Graph 500 | large-scale benchmarks
Graph 500というスパコンベンチがあって、これのコードは公開されているので触ってみた。 スパコン持ってないので、実験機材は普通のノートPCにUbuntu 16.04が入ったもの。
まずはv3.0.0のコードをもらってくる。 https://github.com/graph500/graph500/archive/graph500-3.0.0.tar.gz
mpi関連をインストールする。
apt install mpich
展開する。
tar xzf graph500-3.0.0.tar.gz cd graph500-graph500-3.0.0/
このままビルドするとリンクでエラーになるので、Makefile内のコンパイル引数に指定されている -lpthread とか -lm を後ろに持っていく。
ビルドする。
make
ビルド結果としては4つの実行ファイルが出来上がるが、名前に reference と付いている方は実行可能で、 custom と付いている方は動かない(本来の目的である、自分の実装をするためのものなので)。
ローカルでmpiの4並列実行してみる。
time mpiexec -n 4 ./graph500_reference_bfs 20
結果は長いので最後だけ抜粋。
SCALE: 20 edgefactor: 16 NBFS: 64 graph_generation: 4.61012 num_mpi_processes: 4 construction_time: 1.36205 bfs min_time: 0.277266 bfs firstquartile_time: 0.283024 bfs median_time: 0.291698 bfs thirdquartile_time: 0.302793 bfs max_time: 0.349763 bfs mean_time: 0.295806 bfs stddev_time: 0.0167295 min_nedge: 16775818 firstquartile_nedge: 16775818 median_nedge: 16775818 thirdquartile_nedge: 16775818 max_nedge: 16775818 mean_nedge: 16775818 stddev_nedge: 0 bfs min_TEPS: 4.79634e+07 bfs firstquartile_TEPS: 5.54037e+07 bfs median_TEPS: 5.75108e+07 bfs thirdquartile_TEPS: 5.92735e+07 bfs max_TEPS: 6.05044e+07 bfs harmonic_mean_TEPS: ! 5.67123e+07 bfs harmonic_stddev_TEPS: 404095 bfs min_validate: 1.18584 bfs firstquartile_validate: 1.21473 bfs median_validate: 1.22582 bfs thirdquartile_validate: 1.26528 bfs max_validate: 1.44657 bfs mean_validate: 1.24752 bfs stddev_validate: 0.0512569 real 1m50.265s user 6m41.675s sys 0m25.753s
なんとなく動いた。
Complete Results | Graph 500 を見るとパソコンレベルの1ノード構成でも1GTEPSくらいは出るみたいなので、max 0.06GTEPSはかなり遅い気がする。
reference だとそんなもんなんだろうか?
